Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC50Q8IVM0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC50Q8IVM0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC50Q8IVM0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC50Q8IVM0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC50Q8IVM0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms