Protein–RNA interactions for Protein: Q86W54

SPATA24, Spermatogenesis-associated protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA24Q86W54 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA24Q86W54 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA24Q86W54 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA24Q86W54 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA24Q86W54 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA24Q86W54 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA24Q86W54 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA24Q86W54 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA24Q86W54 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA24Q86W54 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA24Q86W54 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA24Q86W54 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA24Q86W54 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPATA24Q86W54 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA24Q86W54 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA24Q86W54 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms