Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF554Q86TJ5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF554Q86TJ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF554Q86TJ5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF554Q86TJ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms