Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMC3Q7Z5M5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMC3Q7Z5M5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMC3Q7Z5M5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMC3Q7Z5M5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC3Q7Z5M5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms