Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q71RC1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q71RC1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q71RC1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q71RC1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q71RC1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q71RC1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q71RC1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q71RC1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q71RC1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q71RC1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q71RC1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q71RC1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q71RC1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q71RC1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q71RC1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q71RC1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q71RC1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q71RC1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q71RC1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q71RC1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q71RC1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q71RC1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q71RC1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q71RC1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q71RC1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q71RC1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q71RC1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q71RC1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q71RC1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q71RC1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q71RC1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q71RC1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q71RC1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q71RC1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q71RC1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q71RC1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q71RC1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q71RC1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q71RC1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q71RC1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q71RC1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q71RC1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q71RC1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q71RC1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Q71RC1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q71RC1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q71RC1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q71RC1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q71RC1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q71RC1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q71RC1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q71RC1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q71RC1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q71RC1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q71RC1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q71RC1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q71RC1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q71RC1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q71RC1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q71RC1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q71RC1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q71RC1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q71RC1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q71RC1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q71RC1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q71RC1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q71RC1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q71RC1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q71RC1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q71RC1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q71RC1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q71RC1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q71RC1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q71RC1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q71RC1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q71RC1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q71RC1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q71RC1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q71RC1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q71RC1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q71RC1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q71RC1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q71RC1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q71RC1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q71RC1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q71RC1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q71RC1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q71RC1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q71RC1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q71RC1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q71RC1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q71RC1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q71RC1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q71RC1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q71RC1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q71RC1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q71RC1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms