Protein–RNA interactions for Protein: Q70SY1

CREB3L2, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L2Q70SY1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L2Q70SY1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L2Q70SY1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L2Q70SY1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CREB3L2Q70SY1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L2Q70SY1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L2Q70SY1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L2Q70SY1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L2Q70SY1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L2Q70SY1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L2Q70SY1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L2Q70SY1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L2Q70SY1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L2Q70SY1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L2Q70SY1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L2Q70SY1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L2Q70SY1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms