Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD4L3Q6VB84 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD4L3Q6VB84 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD4L3Q6VB84 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD4L3Q6VB84 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD4L3Q6VB84 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD4L3Q6VB84 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD4L3Q6VB84 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD4L3Q6VB84 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD4L3Q6VB84 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD4L3Q6VB84 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD4L3Q6VB84 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms