Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINGO4Q6UY18 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINGO4Q6UY18 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINGO4Q6UY18 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINGO4Q6UY18 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms