Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HRCT1Q6UXD1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HRCT1Q6UXD1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms