Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI25

CNIH2, Protein cornichon homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2Q6PI25 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNIH2Q6PI25 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNIH2Q6PI25 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNIH2Q6PI25 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNIH2Q6PI25 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms