Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE12Q6L8Q7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE12Q6L8Q7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE12Q6L8Q7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE12Q6L8Q7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE12Q6L8Q7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE12Q6L8Q7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE12Q6L8Q7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE12Q6L8Q7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE12Q6L8Q7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE12Q6L8Q7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE12Q6L8Q7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE12Q6L8Q7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE12Q6L8Q7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE12Q6L8Q7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE12Q6L8Q7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE12Q6L8Q7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE12Q6L8Q7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE12Q6L8Q7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE12Q6L8Q7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE12Q6L8Q7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE12Q6L8Q7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE12Q6L8Q7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE12Q6L8Q7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE12Q6L8Q7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE12Q6L8Q7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE12Q6L8Q7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE12Q6L8Q7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms