Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
E4F1Q66K89 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E4F1Q66K89 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
E4F1Q66K89 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E4F1Q66K89 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E4F1Q66K89 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E4F1Q66K89 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E4F1Q66K89 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E4F1Q66K89 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E4F1Q66K89 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E4F1Q66K89 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
E4F1Q66K89 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
E4F1Q66K89 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
E4F1Q66K89 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
E4F1Q66K89 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
E4F1Q66K89 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
E4F1Q66K89 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms