Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2CLQ60I27 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ALS2CLQ60I27 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALS2CLQ60I27 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2CLQ60I27 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2CLQ60I27 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms