Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF6Q5VXH4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF6Q5VXH4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF6Q5VXH4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms