Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM208BQ5VWN6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM208BQ5VWN6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM208BQ5VWN6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM208BQ5VWN6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM208BQ5VWN6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM208BQ5VWN6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM208BQ5VWN6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM208BQ5VWN6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM208BQ5VWN6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM208BQ5VWN6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM208BQ5VWN6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM208BQ5VWN6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM208BQ5VWN6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM208BQ5VWN6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM208BQ5VWN6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM208BQ5VWN6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM208BQ5VWN6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM208BQ5VWN6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM208BQ5VWN6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms