Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NHSL1Q5SYE7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NHSL1Q5SYE7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NHSL1Q5SYE7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NHSL1Q5SYE7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
NHSL1Q5SYE7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NHSL1Q5SYE7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NHSL1Q5SYE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NHSL1Q5SYE7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NHSL1Q5SYE7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NHSL1Q5SYE7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NHSL1Q5SYE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NHSL1Q5SYE7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NHSL1Q5SYE7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NHSL1Q5SYE7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NHSL1Q5SYE7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NHSL1Q5SYE7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NHSL1Q5SYE7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
NHSL1Q5SYE7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NHSL1Q5SYE7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NHSL1Q5SYE7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NHSL1Q5SYE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NHSL1Q5SYE7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
NHSL1Q5SYE7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NHSL1Q5SYE7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NHSL1Q5SYE7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NHSL1Q5SYE7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NHSL1Q5SYE7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NHSL1Q5SYE7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NHSL1Q5SYE7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NHSL1Q5SYE7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NHSL1Q5SYE7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NHSL1Q5SYE7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NHSL1Q5SYE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NHSL1Q5SYE7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NHSL1Q5SYE7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NHSL1Q5SYE7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NHSL1Q5SYE7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NHSL1Q5SYE7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NHSL1Q5SYE7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NHSL1Q5SYE7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NHSL1Q5SYE7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NHSL1Q5SYE7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NHSL1Q5SYE7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NHSL1Q5SYE7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NHSL1Q5SYE7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NHSL1Q5SYE7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NHSL1Q5SYE7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NHSL1Q5SYE7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NHSL1Q5SYE7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NHSL1Q5SYE7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NHSL1Q5SYE7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NHSL1Q5SYE7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NHSL1Q5SYE7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms