Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ODF2Q5BJF6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ODF2Q5BJF6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ODF2Q5BJF6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ODF2Q5BJF6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ODF2Q5BJF6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms