Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AA4PQ58FG1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AA4PQ58FG1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSP90AA4PQ58FG1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSP90AA4PQ58FG1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AA4PQ58FG1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AA4PQ58FG1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AA4PQ58FG1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AA4PQ58FG1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AA4PQ58FG1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AA4PQ58FG1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AA4PQ58FG1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSP90AA4PQ58FG1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSP90AA4PQ58FG1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSP90AA4PQ58FG1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSP90AA4PQ58FG1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HSP90AA4PQ58FG1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HSP90AA4PQ58FG1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms