Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGO2Q562F6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGO2Q562F6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGO2Q562F6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGO2Q562F6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGO2Q562F6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGO2Q562F6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGO2Q562F6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGO2Q562F6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SGO2Q562F6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGO2Q562F6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGO2Q562F6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGO2Q562F6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms