Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSD17B12Q53GQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSD17B12Q53GQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms