Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N7

FAM229B, Protein FAM229B, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM229BQ4G0N7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM229BQ4G0N7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM229BQ4G0N7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM229BQ4G0N7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM229BQ4G0N7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM229BQ4G0N7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM229BQ4G0N7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM229BQ4G0N7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM229BQ4G0N7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms