Protein–RNA interactions for Protein: Q49A17

GALNTL6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNTL6Q49A17 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GALNTL6Q49A17 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GALNTL6Q49A17 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GALNTL6Q49A17 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GALNTL6Q49A17 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GALNTL6Q49A17 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GALNTL6Q49A17 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GALNTL6Q49A17 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GALNTL6Q49A17 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GALNTL6Q49A17 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GALNTL6Q49A17 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GALNTL6Q49A17 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GALNTL6Q49A17 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GALNTL6Q49A17 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GALNTL6Q49A17 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GALNTL6Q49A17 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GALNTL6Q49A17 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms