Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM71Q2Q1W2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM71Q2Q1W2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM71Q2Q1W2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM71Q2Q1W2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM71Q2Q1W2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM71Q2Q1W2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM71Q2Q1W2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM71Q2Q1W2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM71Q2Q1W2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM71Q2Q1W2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM71Q2Q1W2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM71Q2Q1W2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM71Q2Q1W2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM71Q2Q1W2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM71Q2Q1W2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms