Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CTC1Q2NKJ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTC1Q2NKJ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTC1Q2NKJ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTC1Q2NKJ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTC1Q2NKJ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms