Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NTRK2Q16620 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK2Q16620 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK2Q16620 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK2Q16620 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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