Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9Q16594 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF9Q16594 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF9Q16594 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF9Q16594 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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