Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA6Q16445 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA6Q16445 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA6Q16445 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA6Q16445 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA6Q16445 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA6Q16445 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA6Q16445 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA6Q16445 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA6Q16445 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA6Q16445 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA6Q16445 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA6Q16445 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA6Q16445 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA6Q16445 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA6Q16445 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRA6Q16445 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRA6Q16445 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRA6Q16445 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA6Q16445 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms