Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYCP1Q15431 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYCP1Q15431 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYCP1Q15431 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP1Q15431 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP1Q15431 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP1Q15431 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP1Q15431 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP1Q15431 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP1Q15431 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP1Q15431 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP1Q15431 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP1Q15431 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP1Q15431 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SYCP1Q15431 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP1Q15431 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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