Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNPS1Q15287 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNPS1Q15287 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNPS1Q15287 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNPS1Q15287 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms