Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETDB1Q15047 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETDB1Q15047 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETDB1Q15047 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETDB1Q15047 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETDB1Q15047 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SETDB1Q15047 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETDB1Q15047 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETDB1Q15047 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETDB1Q15047 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SETDB1Q15047 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SETDB1Q15047 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms