Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2CQ14957 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2CQ14957 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2CQ14957 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2CQ14957 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2CQ14957 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2CQ14957 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2CQ14957 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2CQ14957 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2CQ14957 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2CQ14957 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2CQ14957 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2CQ14957 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2CQ14957 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2CQ14957 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2CQ14957 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2CQ14957 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2CQ14957 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2CQ14957 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2CQ14957 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2CQ14957 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2CQ14957 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2CQ14957 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2CQ14957 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2CQ14957 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2CQ14957 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
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