Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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