Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CNGB1Q14028 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CNGB1Q14028 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CNGB1Q14028 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CNGB1Q14028 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CNGB1Q14028 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CNGB1Q14028 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CNGB1Q14028 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CNGB1Q14028 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CNGB1Q14028 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CNGB1Q14028 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CNGB1Q14028 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CNGB1Q14028 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CNGB1Q14028 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CNGB1Q14028 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CNGB1Q14028 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNGB1Q14028 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CNGB1Q14028 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CNGB1Q14028 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CNGB1Q14028 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CNGB1Q14028 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CNGB1Q14028 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CNGB1Q14028 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CNGB1Q14028 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CNGB1Q14028 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
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