Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

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Length 1,273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RASGRF1Q13972 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RASGRF1Q13972 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RASGRF1Q13972 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RASGRF1Q13972 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RASGRF1Q13972 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RASGRF1Q13972 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RASGRF1Q13972 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RASGRF1Q13972 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RASGRF1Q13972 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RASGRF1Q13972 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RASGRF1Q13972 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RASGRF1Q13972 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RASGRF1Q13972 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RASGRF1Q13972 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RASGRF1Q13972 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RASGRF1Q13972 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RASGRF1Q13972 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RASGRF1Q13972 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RASGRF1Q13972 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RASGRF1Q13972 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RASGRF1Q13972 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RASGRF1Q13972 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RASGRF1Q13972 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RASGRF1Q13972 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RASGRF1Q13972 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RASGRF1Q13972 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RASGRF1Q13972 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RASGRF1Q13972 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
RASGRF1Q13972 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
RASGRF1Q13972 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
RASGRF1Q13972 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RASGRF1Q13972 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
RASGRF1Q13972 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
RASGRF1Q13972 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
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