Protein–RNA interactions for Protein: Q13459

MYO9B, Unconventional myosin-IXb, humanhuman

Predictions only

Length 2,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO9BQ13459 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYO9BQ13459 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MYO9BQ13459 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYO9BQ13459 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYO9BQ13459 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYO9BQ13459 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYO9BQ13459 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO9BQ13459 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYO9BQ13459 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO9BQ13459 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYO9BQ13459 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYO9BQ13459 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYO9BQ13459 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO9BQ13459 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO9BQ13459 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO9BQ13459 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO9BQ13459 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO9BQ13459 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO9BQ13459 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO9BQ13459 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYO9BQ13459 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYO9BQ13459 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO9BQ13459 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO9BQ13459 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO9BQ13459 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO9BQ13459 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO9BQ13459 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO9BQ13459 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO9BQ13459 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO9BQ13459 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms