Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDCLQ13371 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCLQ13371 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCLQ13371 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCLQ13371 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCLQ13371 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCLQ13371 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCLQ13371 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCLQ13371 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCLQ13371 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCLQ13371 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCLQ13371 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCLQ13371 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms