Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SELENBP1Q13228 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SELENBP1Q13228 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENBP1Q13228 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SELENBP1Q13228 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SELENBP1Q13228 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SELENBP1Q13228 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SELENBP1Q13228 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SELENBP1Q13228 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SELENBP1Q13228 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SELENBP1Q13228 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SELENBP1Q13228 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SELENBP1Q13228 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SELENBP1Q13228 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SELENBP1Q13228 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SELENBP1Q13228 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms