Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANK3Q12955 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms