Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIGFQ07326 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIGFQ07326 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIGFQ07326 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIGFQ07326 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIGFQ07326 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIGFQ07326 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIGFQ07326 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIGFQ07326 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms