Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE3AQ05086 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE3AQ05086 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE3AQ05086 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE3AQ05086 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE3AQ05086 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE3AQ05086 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE3AQ05086 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE3AQ05086 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE3AQ05086 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE3AQ05086 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE3AQ05086 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE3AQ05086 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE3AQ05086 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBE3AQ05086 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBE3AQ05086 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE3AQ05086 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE3AQ05086 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE3AQ05086 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE3AQ05086 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE3AQ05086 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE3AQ05086 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE3AQ05086 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE3AQ05086 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE3AQ05086 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE3AQ05086 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3AQ05086 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3AQ05086 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3AQ05086 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3AQ05086 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3AQ05086 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3AQ05086 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3AQ05086 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3AQ05086 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3AQ05086 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3AQ05086 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3AQ05086 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3AQ05086 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms