Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOTCH2Q04721 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTCH2Q04721 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH2Q04721 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTCH2Q04721 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOTCH2Q04721 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH2Q04721 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOTCH2Q04721 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTCH2Q04721 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH2Q04721 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOTCH2Q04721 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOTCH2Q04721 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH2Q04721 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH2Q04721 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH2Q04721 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH2Q04721 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH2Q04721 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH2Q04721 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH2Q04721 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH2Q04721 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH2Q04721 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms