Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1DQ01668 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CACNA1DQ01668 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1DQ01668 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms