Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL13RA1P78552 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL13RA1P78552 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL13RA1P78552 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL13RA1P78552 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL13RA1P78552 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL13RA1P78552 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL13RA1P78552 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL13RA1P78552 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL13RA1P78552 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL13RA1P78552 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IL13RA1P78552 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL13RA1P78552 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL13RA1P78552 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL13RA1P78552 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms