Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE2IP63279 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE2IP63279 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE2IP63279 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2IP63279 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2IP63279 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2IP63279 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2IP63279 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2IP63279 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2IP63279 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE2IP63279 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE2IP63279 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE2IP63279 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE2IP63279 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE2IP63279 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2IP63279 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE2IP63279 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2IP63279 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2IP63279 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2IP63279 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2IP63279 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2IP63279 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2IP63279 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2IP63279 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2IP63279 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2IP63279 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2IP63279 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2IP63279 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2IP63279 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2IP63279 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2IP63279 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2IP63279 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2IP63279 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2IP63279 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms