Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL23P62829 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL23P62829 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL23P62829 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL23P62829 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL23P62829 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL23P62829 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL23P62829 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL23P62829 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL23P62829 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL23P62829 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL23P62829 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL23P62829 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL23P62829 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL23P62829 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL23P62829 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL23P62829 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL23P62829 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL23P62829 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL23P62829 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL23P62829 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL23P62829 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL23P62829 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL23P62829 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL23P62829 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL23P62829 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL23P62829 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL23P62829 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL23P62829 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL23P62829 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL23P62829 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL23P62829 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL23P62829 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL23P62829 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL23P62829 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL23P62829 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL23P62829 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL23P62829 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL23P62829 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL23P62829 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL23P62829 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL23P62829 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23P62829 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23P62829 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23P62829 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23P62829 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23P62829 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23P62829 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL23P62829 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL23P62829 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL23P62829 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL23P62829 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL23P62829 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL23P62829 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23P62829 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23P62829 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23P62829 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23P62829 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23P62829 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23P62829 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23P62829 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23P62829 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23P62829 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23P62829 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23P62829 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23P62829 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL23P62829 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL23P62829 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL23P62829 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL23P62829 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL23P62829 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL23P62829 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL23P62829 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL23P62829 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL23P62829 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL23P62829 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL23P62829 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL23P62829 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL23P62829 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL23P62829 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL23P62829 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL23P62829 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL23P62829 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL23P62829 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL23P62829 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL23P62829 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL23P62829 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL23P62829 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL23P62829 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL23P62829 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL23P62829 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23P62829 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23P62829 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23P62829 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23P62829 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23P62829 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23P62829 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL23P62829 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL23P62829 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL23P62829 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms