Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2NP61088 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2NP61088 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2NP61088 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2NP61088 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms