Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42P60953 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42P60953 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42P60953 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42P60953 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42P60953 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42P60953 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42P60953 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42P60953 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42P60953 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42P60953 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42P60953 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42P60953 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42P60953 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42P60953 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42P60953 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42P60953 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42P60953 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42P60953 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42P60953 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42P60953 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42P60953 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42P60953 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42P60953 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDC42P60953 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42P60953 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42P60953 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42P60953 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42P60953 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42P60953 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42P60953 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42P60953 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42P60953 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42P60953 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42P60953 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42P60953 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42P60953 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42P60953 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42P60953 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42P60953 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42P60953 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42P60953 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42P60953 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42P60953 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42P60953 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42P60953 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42P60953 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42P60953 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42P60953 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42P60953 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42P60953 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42P60953 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42P60953 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42P60953 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42P60953 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42P60953 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42P60953 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42P60953 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42P60953 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42P60953 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42P60953 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42P60953 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42P60953 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42P60953 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42P60953 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42P60953 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42P60953 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42P60953 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42P60953 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42P60953 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42P60953 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42P60953 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42P60953 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42P60953 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42P60953 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42P60953 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42P60953 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42P60953 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42P60953 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42P60953 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42P60953 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42P60953 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42P60953 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42P60953 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42P60953 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42P60953 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42P60953 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42P60953 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42P60953 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42P60953 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42P60953 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42P60953 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42P60953 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42P60953 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42P60953 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42P60953 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42P60953 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42P60953 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42P60953 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42P60953 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms