Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD4P55036 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD4P55036 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD4P55036 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD4P55036 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD4P55036 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms