Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAA2P54646 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAA2P54646 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAA2P54646 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAA2P54646 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAA2P54646 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAA2P54646 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAA2P54646 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAA2P54646 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAA2P54646 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAA2P54646 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAA2P54646 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAA2P54646 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAA2P54646 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAA2P54646 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKAA2P54646 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAA2P54646 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAA2P54646 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRKAA2P54646 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAA2P54646 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAA2P54646 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAA2P54646 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAA2P54646 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAA2P54646 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAA2P54646 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms