Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
YARSP54577 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
YARSP54577 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
YARSP54577 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YARSP54577 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
YARSP54577 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
YARSP54577 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
YARSP54577 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
YARSP54577 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
YARSP54577 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
YARSP54577 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
YARSP54577 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
YARSP54577 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
YARSP54577 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
YARSP54577 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
YARSP54577 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
YARSP54577 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
YARSP54577 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
YARSP54577 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
YARSP54577 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
YARSP54577 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
YARSP54577 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
YARSP54577 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
YARSP54577 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
YARSP54577 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
YARSP54577 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
YARSP54577 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
YARSP54577 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
YARSP54577 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
YARSP54577 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
YARSP54577 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YARSP54577 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YARSP54577 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YARSP54577 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YARSP54577 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
YARSP54577 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
YARSP54577 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YARSP54577 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YARSP54577 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YARSP54577 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YARSP54577 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YARSP54577 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YARSP54577 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YARSP54577 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YARSP54577 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YARSP54577 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YARSP54577 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
YARSP54577 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YARSP54577 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YARSP54577 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YARSP54577 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YARSP54577 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YARSP54577 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YARSP54577 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YARSP54577 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YARSP54577 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YARSP54577 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YARSP54577 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
YARSP54577 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YARSP54577 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
YARSP54577 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
YARSP54577 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YARSP54577 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
YARSP54577 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
YARSP54577 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
YARSP54577 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YARSP54577 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YARSP54577 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YARSP54577 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
YARSP54577 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
YARSP54577 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YARSP54577 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YARSP54577 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YARSP54577 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YARSP54577 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YARSP54577 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
YARSP54577 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YARSP54577 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YARSP54577 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YARSP54577 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YARSP54577 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YARSP54577 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YARSP54577 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
YARSP54577 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YARSP54577 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
YARSP54577 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YARSP54577 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YARSP54577 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
YARSP54577 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YARSP54577 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YARSP54577 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YARSP54577 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YARSP54577 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YARSP54577 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YARSP54577 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YARSP54577 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
YARSP54577 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
YARSP54577 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YARSP54577 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YARSP54577 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms